之前照顾翔一的心理医生国枝东突然拜访他，与此同时，最强UNKNOWN－BeetleLord出现，翔一变身为燃烧型态迎战。但因为燃烧型态的力量过于强劲，翔一无法自控并且袭击国枝。袭击过后的翔一十分失落，为了开解翔一，国枝道出了自己的一段过去…aaa

霓虹闪烁的大都市，彩虹旋风突然降临。操真晴人（白石隼也饰）与操纵这一切的金色魔法师（阵内孝则饰）对决，却最终陷入昏迷。当他和阿历（奥仲麻琴饰）苏醒后发现，整个世界都变成了魔法国度，人们通过变身腰带和魔法戒指随心所欲使用魔法，并且习以为常，乐在其中。虽然也有Phantom作乱，但是每一个市民都可以变成假面骑士打败进犯者。二人因身份可疑，遭到大门凛子（高山侑子饰）逮捕，继而被送到魔法王国统治者玛雅大王（忍成修吾饰）的宫殿。困扰的二人与新结识的朋友们，必须迎来一连串的挑战。                  eee                 　　在这个甚为怪异的平行世界，他们该如何打败金色魔法师，回到原来的世界呢？

1999年，墜落地球的巨大隕石奪去了整個海洋。與此同時，地球外生物WORM亦開始在世界各地繁殖。為了對抗在一瞬間支配了廣泛地區的WORM，人類成立了對WORM組織ZECT。ZECT開發出幪面超人系統，投入戰場與WORM展開激戰，時間就在這場戰爭中渡過了七年。                  eee                 　　2006年，在這個沙漠化的地球上，部分ZECT的成員因為不滿組織的束縛而結成獨立團體NEOZECT，而ZECT亦開始對這群背叛者進行肅清。就在這時，天道總司，即是假面騎士KABUTO的出現，令戰局產生極大變化。                                   　　ZECT總部得到一顆巨型冰塊彗星正在接近地球，於是提出「天空之梯子計劃」，於大氣層的太空站設置巨型CLOCKUP機器，製造轉移空間把彗星拉往地球，製造出莫大的水源。透過這個計劃，ZECT的權力就會越趨龐大，足以支配地球。                                   　　ZECT利用連接地球和宇宙的軌道電梯發動「天空之梯子計劃」，而從天道手上得知這項情報的NEOZECT，亦決定搶奪這個計劃，壓抑ZECT繼續增大權力。                                   　　為了組織而戰的ZECT戰士大和鐵騎與矢車想；                                   　　為了自由而戰的NEOZECT戰士織田秀成和風間大介；                                   　　為了最愛的日和而戰的加賀美新，還有目的完全不明的天道總司；                                   　　以及身份神秘的黃金假面騎士。                                   　　在各人思想交錯的漩渦中，假面騎士的戰鬥已延伸到浩瀚宇宙…

和平年代，继承了假面超人Kiva衣钵的少年红渡（濑户康史饰）进入森罗高中，展开了磕磕绊绊的校园生活。某天，一名仓皇落魄的逃犯闯入高中，此人名叫杉村隆（堀内健饰），是一个历经22年岁月未见衰老的奇怪之人。一阵混乱过后，杉村隆被两个疑似Fangire的怪人劫持。从假面骑士Rey白峰天斗（山本匠马饰）和名护启介（加藤庆祐饰）的口中得知，杉村不老的秘密极可能和22年前其亲手策划的劫持女子音乐家的事件有关，而这一切导致了最为恐怖的上古魔王Legendora的复活。                  bbb                 　　为了阻止Legendora的阴谋，红渡穿越时空回到了1986年，并且见到了自己的父亲红音也（武田航平饰）。他与父亲试图改变历史，然而一切依旧朝着最糟糕的事态发展……

美术馆仓库内的一副石棺因为意外而打开，被封印了800年的Greeed因此而复活。复活后的Greeed力量并不完全，所以他们以组成身体的硬币制造出“Yummy”。Yummy通过吸食人类欲望而成长，同时体内的硬币也会增加。Greeed以此收集硬币。                  aaa                 　　偶然卷入复活事件的无理想、无欲望青年火野映司，因为自身的正义感而与Yummy战斗。而五个Greeed之一的Ankh，因为硬币的不足而导致除右手外都不能变身。Ankh看中了映司单纯的性格，于是把OOODriver交给映司，让映司变身为假面骑士OOO消灭Yummy，自己从中获得硬币。                                   　　假面骑士OOO的战斗到底会如何？Ankh能否重新获得身体？同时，与Greeed有莫大关系的“鸿上基金会”的目的又是什么？                                   　　带着众多谜团，假面骑士OOO的故事开始了……

由于两位假面骑士的活跃，邪恶组织·杰鲁修卡被消灭，但是首领又创建了新组织·毒蝎帮(又译“迪斯特龙”)。本乡猛的学弟·风见志郎偶然目击毒蝎帮的行动，而受到该邪恶组织的追杀，之后父母以及妹妹都被毒蝎帮的怪人所杀。志郎为了向毒蝎帮军复仇而要求1号和2号替他改造，但二人知道改造人的悲哀，而拒绝了他。后来1号和2号落入了毒蝎帮的陷阱而陷入危机，志郎舍命相救，被机关所伤而奄奄一息，为了救他一命，1号、2号不得不将他改造成改造人·假面骑士V3bbb

在风之街“风都”，左翔太郎、拍档菲利普以及所长鸣海亚树子三人经营着侦探事务所。看似一片和平的风都背后，神秘组织在地下流通着能让普通人变成Dopant的“恶之盖亚存储条”。而造成众多离奇事件的神秘组织核心“园咲家”的每个人，都在风都有着很大的影响力。挑战Dopant们引发离奇事件的翔太郎和菲利普两人，使用六根“盖亚存储条”合体变身成假面骑士W，决然地对抗着园咲家族。                  ccc                 　　园咲家族的目的到底是什么？假面骑士W、菲利普神秘的过去又是什么？隐含着众多谜题，假面骑士W的战斗拉开帷幕……

神秘组织·GOD看中了神敬太郎博士的人类工学技术，逼迫其加入，教授拒绝而遭袭击，儿子神敬介也被杀害，身受重伤的父亲为了让儿子复活，不顾自己的伤势，亲自执刀为儿子进行改造手术。敬介醒来后，父亲已死，透过计算机留言，敬介了解GOD欲危害世界的阴谋，于是背负起对抗邪恶的责任，成为第五号的假面骑士·假面骑士Xccc

一万年前,52张卡封印著不死的生命体,直到20世纪,这些封印被破解,使这些不死生命再次苏醒.为了阻止它们在人类的世界进行杀戮,并把他们再次封印於卡内,被称之为BOARD人类基盘史研究所的鸟丸开发变身腰带.而橘朔也和剑崎真一被委托成为假面骑士Garren和假面骑士Blade而展开他们的英雄之战.故事中的初期橘虽然有协助对抗不死生命体,但他亦对剑等人采取对抗态度,但到了故事的中段便恢复正常．故事中还有第三位由相川始变身的假面骑士，命名为卡利斯,他的正体是Undead－Joker，这亦正亦邪的角色令故事更增添丰富，最後出现的假面骑士是由睦月变身的假面骑士Leangle，一开始被梅花Ａ控制，後得剑和橘等人的帮助，最後亦恢复意志，成为正义的战士ccc

2002年日本发生多宗奇怪的人口失踪案，记者城户真司为了调查此事，便到其中一个受害者榊原耕一的家中调查，期间他发现了一个咭盒，後来真司意外地藉咭盒的力量变成为幪面超人龙骑，并认识了另一Rider秋山莲(幪面超人KNIGHT)和神崎士郎的妹妹神崎优衣。真司当Rider的目的是保护人类和阻止Rider之间的战斗，相反不喜欢战斗的莲为了救爱人，而被逼与其他Rider战斗。随著其他的出现，Rider的战斗渐渐变得激烈，即使真司拼命阻止，但战斗的牺牲者仍来陆续出现。                  eee                 　　就在Rider之间的战斗发展到後期，真司赫然发现神崎士郎发起Rider之间的战斗的原因拯救优衣。原来优衣在小时候已死去，现在优衣的生命是由镜世界的优衣给予的，而这生命在20岁便会用尽，优衣亦会消失。早就得知此事的神崎士郎希望将最後Rider的生命给予优衣，所以便发动Rider之间的战斗。真司知道唯一可以救优衣的方法便是战斗，所以他便要在阻止战斗和拯救优衣之间作出选择。另一方面知道了哥哥的目的的优衣，为了阻止战斗甘愿放弃新生命，并在神崎士郎面前消失。受到优衣的影响，真司决定继续为保护人类而战，可惜最後他为保护一个女孩而被怪物袭击伤重而死。莲则成为最後Rider，成功令爱人苏醒，而自己却伤重而死去。                                   　　战斗结束後，神崎士郎重回过去，再一次发动Rider间的战斗，但被优衣阻止。最後神崎士郎返回过去，令Rider之间的战斗不再发生，所有人都各自过著平凡的生活，而优衣亦已经在小时候就死去。